La division Aviation commerciale et d'affaires voit à l'agrément, à l'inspection et à la vérification des transporteurs aériens pour s'assurer que tout est conforme aux exigences réglementaires. Ce groupe est aussi responsable des aspects opérations, transport des marchandises dangereuses, sécurité à bord en plus de la santé et sécurité au travail.
Le personnel de la division d'Aviation commerciale et d'affaires est chargé de :
Les employés de l'Aviation commerciale et d'affaires sont répartis entre les Centres de Transports Canada de Dorval, Québec et Longueuil.